1. Ruiz, J. 2012. Efectos de la herbivoria foliar en el crecimiento y mortalidad de plantulas de Vochysia ferruginea (Vochysiaceae) en un bosque en regeneracion pos-huracan. Encuentro 91: 76-90.
2. Granzow de la Cerda I., Maya F. L. and Ruiz J. 2011. Tree mortality following ENSO-associated fires and drought in lowland rain forest of Eastern Nicaragua. Forest Ecology and Management 265 (1): 248-257
3. Mascaro J., I. Perfecto, O. Barros, D. H. Boucher, I. Granzow de la Cerda, J. Ruiz and J. Vandermeer. 2005. Aboveground biomass accumulation in a Tropical wet Forest in Nicaragua following a catastrophic hurricane. Biotropica 37(4): 600-608.
4. Ruiz, J. 2011. Observaciones de la historia natural de insecto depredador de semillas de Dipteryx oleifera en Nicaragua. Encuentro 88: 86-100.
5. Ruiz, J., J. Vandermeer, and I. Granzow-de-la-Cerda. 2010. Growth and mortality patterns in the thinning canopy of a post-hurricane rainforest in eastern Nicaragua (1990-2005). Revista de Biología Tropical. 58(4): 1283-1297.
6. Ruiz, J. and Ingram C. 2010. Los humedales de los Cayos Perlas. Wani 61: 69-81.
7. Ruiz, J., C. L. Ingram-Flóres, D. Guillén, R. Tórrez, O. Martínez, and L. F. Chaves. 2010. Ecological consequences of primary and secondary seed dispersal on seed and seedling fate of Dipteryx oleifera (Fabaceae). Revista de Biología Tropical 58(3): 991-1007.
8. Ruiz, J. 2010. Limitacion del Reclutamiento de Plantas. Encuentro 85: 76-77.
9. Ruiz, J. 2010. Hormigas zompopas (Atta cephalotes) influyen positivamente la biodiversidad vegetal de bosques humedos tropicales. Encuentro 86: 29-41.
10. Ruiz, J., H. D. Boucher, D. Ruiz-Moreno, and C. Ingram-Flóres. 2009a. Recruitment dynamics of the tropical rainforest tree Dipteryx oleifera (Fabaceae) in Eastern Nicaragua. Revista de Biología Tropical 57(1-2): 321-338.
11. Ruiz, J., D. H. Boucher, C. Ingram-Flóres, and L. F. Chaves. 2009b. Beneficial effect of spider presence on seedling recruitment of the neotropical tree Dipteryx oleifera (Fabaceae). Revista de Biología Tropical 57(3): 837-846.
12. Ruiz, J. 2009. Ecología de dispersión y reclutamiento de bosques húmedos tropicales. Wani. 59: 17-28.
13. Ruiz, J., and D. H. Boucher. 2008. Recruitment of Dipteryx oleifera Benth (Fabaceae) correlates with bat seed dispersal, rodent seed dispersal and roosting palm species away from conspecific trees. Brenesia 70:1-9.
14. Ruiz, J. 2008. Prueba de las hipótesis de Janzen-Connell y de limitación de reclutamiento en el marco de la organización de bosques húmedos tropicales. Wani 52: 22-33.
15. Ruiz, J., J. Vandermeer, I. Granzow de la Cerda, I. Perfecto, and D. H. Boucher. 2008. Regeneración de bosques huracanados de Nicaragua (1988-2007). Wani 52: 6-16.
16. Ruiz, J. 2004. Seed dispersal, seedling survivorship and tropical forest organization: reconciling the Janzen-Connell and the recruitment limitation hypotheses. Internal Report. Department of Ecology and Evolutionary Biology. The University of Michigan.
17. Ruiz J., 2001. Regeneración de Vochysia ferruginea (Palo de mayo) un árbol de bosque húmedo huracanado e incendiado Nicaragüense: Un modelo de transición matricial. Wani 28: 48-60.
18. Ruiz J., D. H. Boucher, J. H. Vandermeer, I. Granzow de la Cerda, I. Perfecto and Martínez V. 2001. Recuperación Inicial de un Bosque Incendiado y Previamente Afectado por el Huracán Juana en Nicaragua. Encuentro 58: 66-75.
19. Ruiz, J. 1999. Mortalidad, crecimiento y fenología de plántulas del palo de mayo (Vochysia ferruginea) expuestas a la herbivoría foliar en el bosque huracanado del Caribe Nicaragüense. Wani 24: 34-47.
20. Vandermeer J. H., I. Granzow de la Cerda, I. Perfecto, D. Boucher, J. Ruiz, and Kaufmann A. 2002. Multiple basins of attraction in a tropical rain forest: evidence for non-equilibrium community structure. Ecology 85: 575–579.
21. Vandermeer J. H., D. H. Boucher, I. de la Cerda, I. Perfecto and Ruiz J. 2000. Contrasting in the regeneration patterns after tropical disturbances. Science 290: 788–791.
Articles submitted to Journals
22. Ruiz, J. 2010. Literature review on the Janzen-Connell Hypothesis: density and distance dependent seed and seedling survival. Submitted to Brenesia. 25 pp.
Articles in preparation for journals
23. Ruiz, J., Chappell M. J., Boucher D., Vandermeer J. H. and I. Granzow de la Cerda. 2010. A modelling approach to Vochysia ferruginea population after regional forest fires in eastern Nicaragua. 15 pp.
24. Ruiz, J., Ruiz-Moreno, D. and Simoy V. 2010. Oscillatiory dynamics in a predator driven tropical system. Ecological Modelling. In preparation.
25. Ruiz, J. and J. Vandermeer, J. 2010. Neutrality in tree community growth and mortality patterns in a thinning canopy. Ecology. In preparation.
26. Ruiz, J. 2011. Trueques fenologicos en la ecologia de plantas afectadas por herbivoria foliar. Encuentro. In preparation.
27. Dirzo, R. and J. Ruiz. 2012. Changes in biodiversity and the relation with emerging infectious diseases in humans. Journal of Tropical Ecology. In preparation.
Theses
1. Ruiz, J. 2008. Effects of dispersal, seedling recruitment and insect herbivory on seedlings of Dipteryx oleifera Benth (Fabaceae) a tropical tree. PhD Dissertation. The University of Michigan. 172 pp.
2. Ruiz, J. 2000. Playing the tape again - Recovery for Vochysia ferruginea a tree from Nicaraguan rain forest: A Matrix transition Model. Master of Science Thesis. Wageningen Universiteit, The Netherlands. 73 pp.
3. Ruiz, J. 1997. Mortalidad, crecimiento y fenología de plántulas del palo de mayo (Vochysia ferruginea) expuestas a la herbivoría foliar en el bosque huracanado del Caribe Nicaragüense. Undergraduate thesis. Universidad Centroamericana. 23 pp.
Books
1. Ruiz, J. 2009. Plant Recruitment Limitation. Effects of dispersal and insect herbivory on seedling recruitment of Dipteryx oleifera Benth (Fabaceae) a tropical tree. Verlag Dr. Muller Publishing House Ltd. Germany.
2. Ruiz, J. 2010. Ecología - Fundamentos y Ecosistemas Costeños. Centro de Documentación e Información de la Costa Atlántica de Nicaragua. Centro de Documentacion e Informacion de la Costa Atlantica. Bluefields Indian and Caribbean University. 254 pp.
3. Ruiz, J. In preparation. Hurricane forest of Nicaragua. With 34 Collaborators. To be presented to Oxford University Press. 400 pp.
Popular Publications
1. Ruiz, J. 2002. Manual de Educación Ambiental de las Regiones Autónomas de la Costa Atlántica de Nicaragua. 24 p. USAID, Academia para el Desarrollo Educativo (AED), contract USAID No. 524-C00-9900020-00. Proyecto Base II, Proyecto de AED No. 12-2683. Programa de Educación Básica de Nicaragua, MECD/USAID y, CIDCA-UCA.
2. Ruiz J. 1997. Breve interpretación del Proceso de Investigación Científica. Guía Ambientalista. Managua – Nicaragua. Agosto 1997.
3. Ruiz J. 1997. … En la Costa… ¿un huracán cada siglo? Guía Ambientalista. Managua – Nicaragua. Octubre 1997.
4. Ruiz, J. 1997. El herbivorismo en bosques húmedos del trópico. Alwana 7: 8-10.
5. El Nuevo Diario. 13 de Noviembre de 1999. Nota de prensa.
2. Granzow de la Cerda I., Maya F. L. and Ruiz J. 2011. Tree mortality following ENSO-associated fires and drought in lowland rain forest of Eastern Nicaragua. Forest Ecology and Management 265 (1): 248-257
3. Mascaro J., I. Perfecto, O. Barros, D. H. Boucher, I. Granzow de la Cerda, J. Ruiz and J. Vandermeer. 2005. Aboveground biomass accumulation in a Tropical wet Forest in Nicaragua following a catastrophic hurricane. Biotropica 37(4): 600-608.
4. Ruiz, J. 2011. Observaciones de la historia natural de insecto depredador de semillas de Dipteryx oleifera en Nicaragua. Encuentro 88: 86-100.
5. Ruiz, J., J. Vandermeer, and I. Granzow-de-la-Cerda. 2010. Growth and mortality patterns in the thinning canopy of a post-hurricane rainforest in eastern Nicaragua (1990-2005). Revista de Biología Tropical. 58(4): 1283-1297.
6. Ruiz, J. and Ingram C. 2010. Los humedales de los Cayos Perlas. Wani 61: 69-81.
7. Ruiz, J., C. L. Ingram-Flóres, D. Guillén, R. Tórrez, O. Martínez, and L. F. Chaves. 2010. Ecological consequences of primary and secondary seed dispersal on seed and seedling fate of Dipteryx oleifera (Fabaceae). Revista de Biología Tropical 58(3): 991-1007.
8. Ruiz, J. 2010. Limitacion del Reclutamiento de Plantas. Encuentro 85: 76-77.
9. Ruiz, J. 2010. Hormigas zompopas (Atta cephalotes) influyen positivamente la biodiversidad vegetal de bosques humedos tropicales. Encuentro 86: 29-41.
10. Ruiz, J., H. D. Boucher, D. Ruiz-Moreno, and C. Ingram-Flóres. 2009a. Recruitment dynamics of the tropical rainforest tree Dipteryx oleifera (Fabaceae) in Eastern Nicaragua. Revista de Biología Tropical 57(1-2): 321-338.
11. Ruiz, J., D. H. Boucher, C. Ingram-Flóres, and L. F. Chaves. 2009b. Beneficial effect of spider presence on seedling recruitment of the neotropical tree Dipteryx oleifera (Fabaceae). Revista de Biología Tropical 57(3): 837-846.
12. Ruiz, J. 2009. Ecología de dispersión y reclutamiento de bosques húmedos tropicales. Wani. 59: 17-28.
13. Ruiz, J., and D. H. Boucher. 2008. Recruitment of Dipteryx oleifera Benth (Fabaceae) correlates with bat seed dispersal, rodent seed dispersal and roosting palm species away from conspecific trees. Brenesia 70:1-9.
14. Ruiz, J. 2008. Prueba de las hipótesis de Janzen-Connell y de limitación de reclutamiento en el marco de la organización de bosques húmedos tropicales. Wani 52: 22-33.
15. Ruiz, J., J. Vandermeer, I. Granzow de la Cerda, I. Perfecto, and D. H. Boucher. 2008. Regeneración de bosques huracanados de Nicaragua (1988-2007). Wani 52: 6-16.
16. Ruiz, J. 2004. Seed dispersal, seedling survivorship and tropical forest organization: reconciling the Janzen-Connell and the recruitment limitation hypotheses. Internal Report. Department of Ecology and Evolutionary Biology. The University of Michigan.
17. Ruiz J., 2001. Regeneración de Vochysia ferruginea (Palo de mayo) un árbol de bosque húmedo huracanado e incendiado Nicaragüense: Un modelo de transición matricial. Wani 28: 48-60.
18. Ruiz J., D. H. Boucher, J. H. Vandermeer, I. Granzow de la Cerda, I. Perfecto and Martínez V. 2001. Recuperación Inicial de un Bosque Incendiado y Previamente Afectado por el Huracán Juana en Nicaragua. Encuentro 58: 66-75.
19. Ruiz, J. 1999. Mortalidad, crecimiento y fenología de plántulas del palo de mayo (Vochysia ferruginea) expuestas a la herbivoría foliar en el bosque huracanado del Caribe Nicaragüense. Wani 24: 34-47.
20. Vandermeer J. H., I. Granzow de la Cerda, I. Perfecto, D. Boucher, J. Ruiz, and Kaufmann A. 2002. Multiple basins of attraction in a tropical rain forest: evidence for non-equilibrium community structure. Ecology 85: 575–579.
21. Vandermeer J. H., D. H. Boucher, I. de la Cerda, I. Perfecto and Ruiz J. 2000. Contrasting in the regeneration patterns after tropical disturbances. Science 290: 788–791.
Articles submitted to Journals
22. Ruiz, J. 2010. Literature review on the Janzen-Connell Hypothesis: density and distance dependent seed and seedling survival. Submitted to Brenesia. 25 pp.
Articles in preparation for journals
23. Ruiz, J., Chappell M. J., Boucher D., Vandermeer J. H. and I. Granzow de la Cerda. 2010. A modelling approach to Vochysia ferruginea population after regional forest fires in eastern Nicaragua. 15 pp.
24. Ruiz, J., Ruiz-Moreno, D. and Simoy V. 2010. Oscillatiory dynamics in a predator driven tropical system. Ecological Modelling. In preparation.
25. Ruiz, J. and J. Vandermeer, J. 2010. Neutrality in tree community growth and mortality patterns in a thinning canopy. Ecology. In preparation.
26. Ruiz, J. 2011. Trueques fenologicos en la ecologia de plantas afectadas por herbivoria foliar. Encuentro. In preparation.
27. Dirzo, R. and J. Ruiz. 2012. Changes in biodiversity and the relation with emerging infectious diseases in humans. Journal of Tropical Ecology. In preparation.
Reviewer for Scientific Journals
1. Revista de Biología Tropical (Costa Rica).
2. Animal Behaviour (England).
3. African Journal Biochemistry Research.
4. Acta Biológica Colombiana (Colombia).
5. Revista Encuentro (Nicaragua). Member of Scientific Board.
4. Acta Biológica Colombiana (Colombia).
5. Revista Encuentro (Nicaragua). Member of Scientific Board.
Theses
1. Ruiz, J. 2008. Effects of dispersal, seedling recruitment and insect herbivory on seedlings of Dipteryx oleifera Benth (Fabaceae) a tropical tree. PhD Dissertation. The University of Michigan. 172 pp.
2. Ruiz, J. 2000. Playing the tape again - Recovery for Vochysia ferruginea a tree from Nicaraguan rain forest: A Matrix transition Model. Master of Science Thesis. Wageningen Universiteit, The Netherlands. 73 pp.
3. Ruiz, J. 1997. Mortalidad, crecimiento y fenología de plántulas del palo de mayo (Vochysia ferruginea) expuestas a la herbivoría foliar en el bosque huracanado del Caribe Nicaragüense. Undergraduate thesis. Universidad Centroamericana. 23 pp.
Books
1. Ruiz, J. 2009. Plant Recruitment Limitation. Effects of dispersal and insect herbivory on seedling recruitment of Dipteryx oleifera Benth (Fabaceae) a tropical tree. Verlag Dr. Muller Publishing House Ltd. Germany.
2. Ruiz, J. 2010. Ecología - Fundamentos y Ecosistemas Costeños. Centro de Documentación e Información de la Costa Atlántica de Nicaragua. Centro de Documentacion e Informacion de la Costa Atlantica. Bluefields Indian and Caribbean University. 254 pp.
3. Ruiz, J. In preparation. Hurricane forest of Nicaragua. With 34 Collaborators. To be presented to Oxford University Press. 400 pp.
Popular Publications
1. Ruiz, J. 2002. Manual de Educación Ambiental de las Regiones Autónomas de la Costa Atlántica de Nicaragua. 24 p. USAID, Academia para el Desarrollo Educativo (AED), contract USAID No. 524-C00-9900020-00. Proyecto Base II, Proyecto de AED No. 12-2683. Programa de Educación Básica de Nicaragua, MECD/USAID y, CIDCA-UCA.
2. Ruiz J. 1997. Breve interpretación del Proceso de Investigación Científica. Guía Ambientalista. Managua – Nicaragua. Agosto 1997.
3. Ruiz J. 1997. … En la Costa… ¿un huracán cada siglo? Guía Ambientalista. Managua – Nicaragua. Octubre 1997.
4. Ruiz, J. 1997. El herbivorismo en bosques húmedos del trópico. Alwana 7: 8-10.
5. El Nuevo Diario. 13 de Noviembre de 1999. Nota de prensa.